Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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