Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATMQ13315 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATMQ13315 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ATMQ13315 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ATMQ13315 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATMQ13315 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATMQ13315 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATMQ13315 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ATMQ13315 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATMQ13315 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATMQ13315 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ATMQ13315 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATMQ13315 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ATMQ13315 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATMQ13315 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATMQ13315 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATMQ13315 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ATMQ13315 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATMQ13315 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATMQ13315 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
ATMQ13315 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ATMQ13315 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ATMQ13315 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATMQ13315 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATMQ13315 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ATMQ13315 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATMQ13315 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATMQ13315 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATMQ13315 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATMQ13315 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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