Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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GRIN2AQ12879 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
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GRIN2AQ12879 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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GRIN2AQ12879 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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GRIN2AQ12879 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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GRIN2AQ12879 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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