Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms