Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NISCHQ9Y2I1 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NISCHQ9Y2I1 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NISCHQ9Y2I1 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NISCHQ9Y2I1 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NISCHQ9Y2I1 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NISCHQ9Y2I1 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NISCHQ9Y2I1 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NISCHQ9Y2I1 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NISCHQ9Y2I1 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NISCHQ9Y2I1 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NISCHQ9Y2I1 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NISCHQ9Y2I1 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NISCHQ9Y2I1 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NISCHQ9Y2I1 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NISCHQ9Y2I1 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NISCHQ9Y2I1 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms