Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.6 ms