Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CUL1Q13616 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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