Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
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