Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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TCIRG1Q13488 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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