Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRSQ13332 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms