Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
CHAF1AQ13111 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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