Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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IFT88Q13099 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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IFT88Q13099 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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IFT88Q13099 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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IFT88Q13099 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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