Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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PTPRMP28827 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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PTPRMP28827 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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PTPRMP28827 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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PTPRMP28827 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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PTPRMP28827 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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