Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms