Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC092421.1-201ENST00000448148 418 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC117383.2-201ENST00000514722 322 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC067735.1-201ENST00000551152 526 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC092868.2-201ENST00000558749 497 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC068152.1-202ENST00000571901 808 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC007879.2-201ENST00000454444 551 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms