Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms