Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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SP140Q13342 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
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SP140Q13342 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
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SP140Q13342 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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SP140Q13342 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
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SP140Q13342 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SP140Q13342 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SP140Q13342 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SP140Q13342 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
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SP140Q13342 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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SP140Q13342 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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