Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn2r25W4VSP2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms