Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms