Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W1

Gm3839, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3839S4R1W1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3839S4R1W1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms