Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms