Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt27Q9Z320 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms