Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtmr1Q9Z2C4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms