Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms