Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms