Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rlbp1Q9Z275 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rlbp1Q9Z275 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rlbp1Q9Z275 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rlbp1Q9Z275 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rlbp1Q9Z275 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rlbp1Q9Z275 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rlbp1Q9Z275 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rlbp1Q9Z275 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rlbp1Q9Z275 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rlbp1Q9Z275 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rlbp1Q9Z275 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rlbp1Q9Z275 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rlbp1Q9Z275 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rlbp1Q9Z275 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rlbp1Q9Z275 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rlbp1Q9Z275 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rlbp1Q9Z275 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rlbp1Q9Z275 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rlbp1Q9Z275 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rlbp1Q9Z275 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms