Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Cldn6Q9Z262 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn6Q9Z262 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn6Q9Z262 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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