Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn8Q9Z260 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn8Q9Z260 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn8Q9Z260 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn8Q9Z260 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn8Q9Z260 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn8Q9Z260 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn8Q9Z260 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn8Q9Z260 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn8Q9Z260 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn8Q9Z260 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn8Q9Z260 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn8Q9Z260 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn8Q9Z260 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn8Q9Z260 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn8Q9Z260 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn8Q9Z260 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn8Q9Z260 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn8Q9Z260 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn8Q9Z260 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn8Q9Z260 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn8Q9Z260 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms