Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Sh3bp5Q9Z131 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Sh3bp5Q9Z131 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Sh3bp5Q9Z131 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Sh3bp5Q9Z131 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Sh3bp5Q9Z131 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Sh3bp5Q9Z131 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Sh3bp5Q9Z131 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Sh3bp5Q9Z131 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Sh3bp5Q9Z131 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Sh3bp5Q9Z131 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Sh3bp5Q9Z131 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Sh3bp5Q9Z131 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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