Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dctn3Q9Z0Y1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms