Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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