Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms