Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tusc2Q9WVF8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms