Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacsin2Q9WVE8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms