Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lemd3Q9WU40 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms