Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Scnn1gQ9WU39 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Scnn1gQ9WU39 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Scnn1gQ9WU39 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1gQ9WU39 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Scnn1gQ9WU39 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1gQ9WU39 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Scnn1gQ9WU39 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms