Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms