Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms