Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms