Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PplQ9R269 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PplQ9R269 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PplQ9R269 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PplQ9R269 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PplQ9R269 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PplQ9R269 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PplQ9R269 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PplQ9R269 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PplQ9R269 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms