Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms