Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim3Q9R1R2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms