Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfwd2Q9R1A8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfwd2Q9R1A8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfwd2Q9R1A8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfwd2Q9R1A8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfwd2Q9R1A8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfwd2Q9R1A8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfwd2Q9R1A8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfwd2Q9R1A8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfwd2Q9R1A8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfwd2Q9R1A8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfwd2Q9R1A8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms