Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms