Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 925 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Npas3Q9QZQ0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Npas3Q9QZQ0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Npas3Q9QZQ0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Npas3Q9QZQ0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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