Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmlQ9QZD5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms