Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms