Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps29Q9QZ88 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms