Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip4Q9QXN3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip4Q9QXN3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms