Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms